首先你要确认你坐的车是不是滴滴出租车，只有出租车才需要确认订单，如果是快车和专车，它们会自动扣费。
第二，如果你坐的是滴滴出租车，确认订单是正常的。你从微信上把车费转给他的意思是，你微信扫码转账给他还是你通过微信进入滴滴确认订单？滴滴出租车不会自动扣费，所以你通过扫码支付和通过进入滴滴确认订单都是一种支付的方式。根据你的描述我认为你可能是扫码支付，就算你扫码支付滴滴也不会自动扣费，所以你只支付了一次。
第三，如果是快车和专车，一般来说它会自动扣费，所以你如果再转账给司机，说明你交了两次钱。有问题先找滴滴投诉这位司机。